Super User
Parazitologická diagnostika
Komplexní parazitologické vyšetření zoologického materiálu. Zahrnuje flotační vyšetření výkalů (stanovení zejména vajíček helmintů, cyst prvoků apod.), kultivační vyšetření (střevní bičíkovci, Blastocystis apod.), případně i možnost PCR diagnostiky (zejména Cryptosporidium, Blastocystis, mikrosporidie aj.). K dispozici mikroskop vybavený digitálním fotoaparátem.
v současné době prováděno v náhradních prostorách (Parazitolog.ústav AV)
Mikrobiologické vyšetření
Kultivační vyšetření surovin a potravin především živočišného původu (mléko, maso, vejce) za účelem stanovení celkových počtů mikroorganismů a dále počtů psychrotrofních a koliformních mikroorganismů, s následným vyhodnocením dle platné legislativy.
Stanovení barvy masa
Barva masa je znakem, podle kterého spotřebitel posuzuje kvalitu masa. V přístrorj ColorEye XTH je vyjadřována v systému CIE pomocí hodnot L*, a* a b*. Nejvýznamnější veličinou je světlost L*, která je funkcí reflektance, tj. poměru intenzity světla odraženého : intenzitě světla dopadajícího. U bílé barvy má hodnotu 100 %, u černé 0 %. Barevný odstín je charakterizován pomocí koeficientů a* a b*. Souřadnice a* udává vztah mezi červenou a zelenou barvou, souřadnice b* mezi žlutou a modrou barvou.
Stanovení textury masa
Metoda analýzy texturního profilu patří mezi jednu z nejpoužívanějších metod mechanického stanovení texturních vlastností. Textura masa je dána jeho strukturou a chemickým složením. Hodnotí se senzoricky nebo objektivně pomocí texturometru. Nejčastěji užívanou veličinou je síla ve střihu (N) naměřená pomocí Warnera a Bratzlera. K měřícímu přístroji je připojen nástavec ve tvaru kovové desky s výřezem tvaru rovnoběžného trojúhelníka, která se zasouvá do štěrbiny a přitom přestřihne vzorek masa definovaných rozměrů.
Stanovení tuku v produktech
Obsah tuku v produktech se obvykle definuje jako tuk, který může být extrahován vhodným rozpouštědlem (petrolether). Přímá extrakce je nenahraditelná pro vysokou přesnost a opakovatelnost. Intramuskulární tuk má v mase význam ze senzorického hlediska a vlivu na křehkost masa Pod tímto pojmem se obecně rozumí lipidy a doprovodné látky lipidů v libové svalovině, která lze extrahovat organickými rozpouštědly. Přístroj Det-Gras provádí klasickou Soxhletovu metodu automaticky v 6 vzorcích současně. V 1. fázi se vzorek vaří v rozpouštědle, během této fáze se rozpustí velká část tuku. Ve 2. fázi je vzorek promýván rozpouštědlem. Následuje oddestilování rozpouštědla do horní části skleněné extrakční komory rozpouštědla
Nízkoobjemová produkce entomopatogenních a mykoparazitických hub
Nabízíme službu zaměřenou na malokapacitní produkci biomasy entomopatogenních a mykoparazitických hub. Spory hub jsme schopni produkovat jak pomocí submerzní kultivace v tekuté živné půdě, tak i produkovat spory na umělých agarizovaných živných půdách a přirozených substrátech. Pomocí technologie jsme schopni finalizovat vyprodukovanou biomasu do standardního biopreparátu určeného k aplikaci v místě výskytu živočišných škůdců popř. na lokality s výskytem fytopatogenních hub (původců onemocnění rostlin).
Programy IOR s podílem hub jako hlavních komponentů
Integrovaná ochrana rostlin (IOR) patří ke klíčovým strategiím aplikovaného rostlinolékařství. Nabízíme službu spojenou s navrhnutím a konzultací výběru vhodné strategie IOR, tj. záměrné podpory a využívání místních přirozeně se vyskytujících druhů/kmenů mitosporických hub a cíleného využití jejich potenciálu při navození vysoké úrovně přirozené supresivity půd a střednědobé stabilizaci tohoto stavu s ohledem na podporu i dalších stabilizujících funkcí této skupiny mikroorganizmů, biologická aktivita půdy. Aktivity spočívají v záměrné podpoře či využití nativních populací organismů (v tomto případě lokálně se vyskytujících kmenů vybraných druhů mikroskopických hub na vybraných lokalitách objednavatelem), tedy populací entomopatogenních a mykoparazitických hub, které jsou přirozenou složkou v daném konkrétním agroekosystému.Realizace konceptu předpokládá jak cílené využití místních populací vybraných druhů mikroskopických hub proti konkrétním druhů živočišných škůdců či původcům onemocnění rostlin, tak i cílené zlepšení vlastností půd definovaných stavem přirozené půdní supresivity – tedy schopnosti potlačovat výskyt a rozvoj škůdců a fytopatogenních organismů.
Hodnocení kvality komerčních biopreparátů na bázi mitosporických hub a houbám podobných organismů (zástupci - Oomycota)
Standardní biopreparáty na bázi entomopatogenních a mykoparazitických hub musejí splňovat řadu kvalitativních a kvantitativních kriterií a podléhají kompletnímu registračnímu procesu. Naše laboratoř je schopna hodnotit jejich kvalitu pomocí klíčových parametrů kvalitativní povahy; specifikaci podílu aktivní a doplňkové složky v biopreparátu. Stanovujeme hlavní kvantitativní parametry houbových biopreparátů jako je stanovení počtu infekčních jednotek – tzv. titr spor garantovaného producentem a distributorem, stanovení vitality spor udávané v % a zároveň jsme schopni hodnotit i vitalitu pomocí testu GI, kdy se každé spoře přiřadí index fáze klíčení. Poslední kvantitativní parametr, který testujeme je počet kolonie tvořících jednotek (CFU – colony forming units). CFU udává kolik jednotek patogena přítomných v 1 g nebo 1 ml biopreparátu utvoří samostatnou kolonii na umělé živné půdě.
Uchovávání matečných kultur hub, dlouhodobé uchovávání kmenů mikroskopických hub
Nabízíme službu dlouhodobého ukládání a uchovávání matečných kultur kmenů vláknitých hub za použití techniky imobilizace biomasy kmenů do alginátových pelet. Alginátové pelety ukládáme do mrazicího boxu při teplotě přibližně -20°C. Uložené kmeny v alginátových peletách jsme schopni aktivovat a jako čistou kulturu zaslat na agarových plotnách. Sbírka entomopatogenních a mykoparazitických hub není oficiální sbírkou, slouží momentálně pro interní potřebu.
Charakteristika kmenů s využitím fenotypových parametrů a biologických parametrů kmenů získaných pomocí „in vitro“ a „in vivo“ systémů)
Identifikace na úrovni druhu představuje mandatorní předpoklad cíleného využívání entomopatogenních a mykoparazitických hub. Identifikace partikulárních kmenů jednotlivých druhů entomopatogenních a mykoparazitických hub představuje velmi složitý problém, jehož obecné řešení spočívá v oblasti aplikace specifických determinačních technik a metod (např. fenotypové a fyziologické markery). Nicméně, z hlediska praktického využití jsou nezbytné základní charakteristiky kmenů, zejména pak kmenově specifické parametrizace rychlosti vývoje (růst středových kultur), produkce spor (množství spor/1 mm2 kultury, resp. spor/1 g přirozeného substrátu), vitalita spor (klíčivost - %) a virulence (účinnost kmene stanovená pomocí standardního laboratorního biotestu). Nabízíme službu polyfaktoriálního hodnotícího systému umožňujícího definovat možnosti následného praktického využití jednotlivých kmenů v kontextu základního cíle – využití lokálních kmenů entomopatogenních a mykoparazitických hub při záměrném navýšení přirozené supresivity zemědělsky využívaných půd.